生物与食品工程学院始建于1956年，1985年成立万县师范专科学校生物科，1994年成立四川三峡学院生物系，2001年更名为重庆三峡学院生物系，2011年成立生命科学与工程学院，2017年更名为生物与食品工程学院。学院现有生物技术、食品科学与工程、食品质量与安全、园艺、农学、智慧农业、风景园林七个本科专业，现招收学科教学（生物）领域教育硕士和农艺与种业、食品加工与安全、资源利用与植物保护3个领域的农业硕士，在校本科生和研究生共计1520余人。

学院师资力量雄厚，现有教职工63人，其中专任教师51人。专任教师中高级职称教师占比49%，具有博士学位教师占比74%，硕士生导师33人，重庆市学术与技术带头人及后备人选、重庆英才、重庆市中青年突出贡献专家等各类人才30人次。现有重庆市重点学科1个、国家级“卓越农林人才教育培养计划”改革试点专业1个、重庆市特色专业1个、重庆市一流专业2个，拥有重庆市2011协同创新中心（分中心）、重庆市工程技术研究中心、重庆市工程实验室、三峡智慧农业学院、三峡库区山地农业三产融合产业学院等5个市级科技创新平台。建有40多个教学科研实验室，教学仪器设备价值近5000万元。近5年先后承担国家自然科学基金、教育部重点项目等省部级项目80余项，在三峡库区消落带适生植被、农业生态、中药材和农产品开发等方面研究成效突出。

近5年学生获中国国际“互联网+”大学生创新创业大赛国赛金奖等国家级和省部级奖40余项，毕业生考研升学率年均25%以上，年终就业去向落实率持续保持在95%以上，稳居全校前茅。