生物与食品工程学院所属实验室位于重庆三峡学院慎思楼2栋，共有实验室45间，其中教学实验室18间（包括虚拟仿真实验室1间），科研团队实验室及教授工作室13间，公共实验室6间，精密仪器室6间，药品库房2间，户外另有温室大棚1间，实验室总面积超3000平米。其中，教学实验室划分4个基础技能实验室（有机化学实验室、无机化学实验室、基础生物化学实验室、微生物实验室）、6个专业技能实验室（食品加工实验室、食品分析检测实验室、分子生物学实验室、细胞生物学实验室、植物学实验室、动物学实验室）和3个教学中心（农产品绿色加工与保鲜技术中心、园艺绘图实训中心、虚拟仿真实验教学中心）。

学院现有教学、科研实验仪器、设备2000余台（件），总价值近4000万元；每年承接实验教学课程100余门，实验教学项目超600个；每年在实验室从事教学、科研人数超1000人。